پروژه‌ها و طرحهاي تحقيقاتي در حال انجام بخش

شناسايي ماركرهاي مولكولي مرتبط با مقاومت به سرما در گندم معمولي

تجزيه تنوع ژنتيكي در ژنوتيپ‌هاي وحشي و زراعي پسته (Pistacia vera) ايران با استفاده از صفات مورفولوژيكي و نشانگرهاي مولكولي (AFLPs و SSRs )

تهيه بانك اطلاعات مولكولي و مورفولوژيكي انار در ايران

مکان يابي ژن هاي مقاومت به سپتوريوز برگ در گندم با استفاده از نشانگرهاي DNA

ايجاد نشانگرهاي مبتني بر PCR پيوسته با مقاومت به سپتوريوز برگ حاصل از ژنهاي کانديد مقاومت در گندم

تنوع ژنتيك رزهاي وحشي ايران با استفاده از نشانگرهاي مولكولي

مکان يابي و بيان افتراقي ژن هاي پاسخگو به تنش شوري در گندم

جداسازي و تعيين مشخصات نشانگرهاي ريز ماهواره از انار

ايجاد نشانگرهاي مولكولي مبتني بر EST پيوسته با مقاومت به بلايت فوزاريومي سنبله در گندم

عنوان طرح/پروژه: شناسايي نشانگرهاي ملکولي مرتبط با مقاومت به سرما در گندم معمولي

شماره مصوب: 83047-0000-00-121400-011-3

مجري مسئول: سيروس محفوظي

مجري/ مجريان: محسن مردي

همكاران: مهربانو کاظمي الموتي

تاريخ خاتمه:1387

خلاصه گزارش: به منظور شناسايي نشانگرهاي ريزماهواره پيوسته با تحمل به سرما در گندم، جمعيت‌ F_2:3 حاصل از تلاقي دو والد ميرنووسكايا 808 (LT50=-21°C) × پيشتاز (LT50=-7°C) در شرايط مزرعه و تحت انجماد مصنوعي مورد ارزيابي فنوتيپي قرار گرفتند. نتايج تجزيه هاي فنوتيپي نشان داد كه والدين و جمعيت‌ در حال تفكيك داراي اختلاف‌هاي معني‌دار از نظر تحمل به سرما بودند. توزيع فراواني مقادير LT50 نشان داد كه تحمل به سرما يك صفت كمّي است. نتايج اوليه تجزيه هاي مولكولي بوسيله 170 نشانگر ريزماهواره نشان داد سه مکان ژني gwm617, gwm371 وgwm174 به ترتيب روي كروموزمهاي 5A، 5B و 5D داراي پيوسته گي معني دار با تحمل به سرما در گندم بودند.

عنوان طرح/پروژه: تجزيه تنوع ژنتيكي در ژنوتيپ‌هاي وحشي و زراعي پسته (Pistacia vera) ايران با استفاده از صفات مورفولوژيكي و نشانگرهاي مولكولي

(AFLPs و SSRs )

شماره مصوب: 85094 -0000-00-141500-100-3

مجري مسئول:

مجري/ مجريان: محسن مردی

همكاران: ليلا پازوكي, سيدمصطفی پيرسيدی

تاريخ خاتمه: 1387

خلاصه گزارش:

يکي از معضلات مهم باغداران در خصوص احداث نهالستانهای پسته، نامشخص بودن اصالت ژنتيکي ارقام کشت شده می باشد. در بسياري از مواقع، باغداران چندين سال وقت و سرمايه خود را براي کشت يک رقم خاص صرف مي کنند و اين درحالی است که رقم کشت شده رقم مورد نظر نيست و به اين ترتيب خسارت جبران ناپذيري به آنها وارد مي شود.عليرغم اينکه پسته يکي از مهمترين محصولات صادراتي ايران به شمارمي رود، اما هيچگونه شناسنامه دقيقی براي تعيين اصالت ژنتيکی ارقام مهم زراعی آن در کشور وجود ندارد. در حال حاضر با استفاده از روشهای نوين بيوتکنولوژی امکان انگشت نگاری ارقام مهم زراعی پسته ايران بر اساس مولکول DNA تحت عنوان "انگشت نگاری DNA "در پژوهشکده بيوتکنولوژی کشاورزی ميسر شده است. در اين تحقيق سيصدو دوازده ژنوتيپ متعلق به 85 گونه بومي و خارجي به همراه 7 جمعيت از 3 گونه وحشي با استفاده از نشانگر هاي ريزماهواره به منظور مطالعه تنوع ژنتيکي درون و بين گونه اي و تعيين ارتباطات فيلوژنتيکي بين گونه هاي Pistacia و همچنين ارزيابي ارتباطات ژنتيکي بين ارقام داخلي و خارجي به منظور تعيين کليدهای اختصاصی مولکولی ارقام مهم مورد بررسي قرار گرفتند. با توجه به تنوع ژنتيکی بسيار بالا پسته در ايران و ضرورت حفظ حقوق مالکيت اين ذخيره توارثی گرانبها, با استفاده از نتايج اوليه اين تحقيق بانک اطلاعات مولکولي پسته ايران شامل کليدهای مولکولی تعدادی از ارقام مهم تجاری به آدرس www.ipmd.ir راه اندازی شد.

عنوان طرح/پروژه: تهيه بانک اطلاعات مولکولي و مورفولوژيکي کلکسيون انار بانک ژن گياهي ملي ايران

شماره مصوب: 84145-0000-00-121400-100-3

مجري مسئول: مهدي زهراوي

مجري/ مجريان: محسن مردي

همكاران: سيد مصطفی پيرسيدی, هاشم پورايراندوست

تاريخ خاتمه: 1388

خلاصه گزارش: جهت تهيه بانک اطلاعات مولکولي و مورفولوژيکي و نيز شناسايي نشانگرهاي Informative  براي صفات مهم زراعي و کيفي انار ،760 نمونه انار موجود در کلکسيون يزد مورد ارزيابي قرار گرفت.DNA  تمام نمونه هاي جمع آوري شده از کلکسيون يزد استخراج شد و مراحل آماده سازي نمونه ها جهت انجام کار با نشانگر AFLP صورت گرفت. از 10 جفت آغازگر اختصاصی به منظور تعيين چندشکلی روي 60 نمونه انتخابی استفاده شد. نتايج اوليه نشان داد جفت آغازگرهای مورد استفاده دارای چندشکلی مناسب در نمونه های مورد مطالعه نبودند در نتيجه ادامه کار با استفاده از نشانگرهای جداسازی شده SSR در سال آينده آغاز می گردد.

عنوان طرح/پروژه: مکان يابي ژنهاي مقاومت به سپتوريوز برگ در گندم با استفاده از نشانگرهاي DNA

شماره مصوب: 86002-8305-00-101400-100-3

مجري مسئول: 

مجري/ مجريان: محسن مردي

همكاران: محمد رضا غفاري, مهربانو کاظمي الموتي

تاريخ خاتمه:1388

خلاصه گزارش: استخراج DNA از 178 لاين حاصل از تلاقي Seri82 * Wangshubai انجام شد. كميت و كيفيت DNA استخراج شده با استفاده از ژل آگارز 8/0% و اسپكتروفتومتري انجام شد. تعداد 170 نشانگر SSR جهت شناسايي نشانگرهاي چندشکل در والدين ارزيابی شد. تجزيه مولکولی جمعيت با استفاده از 42 نشانگر چندشکل SSR انجام شد. تجزيه AFLP با استفاده از 10 تركيب جفت آغازگر اختصاصی انجام شد. ارزيابي فنوتيپي والدين و جمعيت مورد مطالعه با استفاده از ايزوله 50 فارس در قالب سه تکرار به پايان رسيد. در حال حاضر ارزيابي فنوتيپی والدين و جمعيت مورد مطالعه با استفاده از ايزوله هاي ديگر در حال انجام می باشد.

عنوان طرح/پروژه: شناسايي و ايجاد نشانگرهاي مولکولي مبتني بر PCR پيوسته با ژن هاي مقاومت به سپتوريوز برگي در گندم

شماره مصوب: 84003-8305-02-140000-013-2

مجري مسئول:

مجري/ مجريان: محمد رضا غفاري

همكاران: لاله کريمي فرساد, محسن مردی

تاريخ خاتمه: 1387

خلاصه گزارش: كليه پرايمرهاي بانك EST بخش تحقيقات ژنوميكس كه اختصاصا مربوط به پرايمرهايي بوده كه به نحوي در مقاومت به سپتوريوز نقش داشته يا از ژنهاي كانديداي مقاومت به شمار مي رفتند برروي والدين فلات (حساس) و مقاوم (ونگشوباي) مورد آناليز PCR قرار گرفتند. از بين اين پرايمر ها تنها پرايمر  XSTS3B138F داراي باند چند شکل در بين والدين حساس و مقاوم به سپتوريوز. بود. اين پرايمر برروي 138 نمونه از جمعيت F₉ مورد آناليز ملكولي قرار گرفت. با توجه به در حال انجام بودن آناليزهاي فنوتيپي امكان بررسي اثر اين ژن در مقاومت به سپتوريوز و مكان احتمالي آن برروي كروموزوم در حال انجام می باشد. جهت بررسي بيان كمي تعداد 20 ژن كانديداي مقاومت به بيماري يا ژنهايي كه در مسير سيگنالينگ ژنهاي كانديداي مقاومت موثر هستند نمونه گيري از گياهان آلوده (آلودگي به ميزان 2x10⁶ كنيدي در واحد ميلي ليتر صورت گرفت ) و غيرآلوده به سپتوريوز در سه تكرار و براي زمانهاي0، 1، 2 ، 4، 8 و 12 روز بعد از آلودگي انجام شد. در هر مرحله گياهان شاهد با استفاده از آب اسپري شدند.

عنوان طرح/پروژه: جداسازي و تعيين مشخصات نشانگرهاي ريز ماهواره از انار(Punica granatum L)  

شماره مصوب: 2-013-140000-02-0000-85005

مجري مسئول:

مجري/ مجريان: سيد مصطفي پيرسيدي

همكاران:محسن مردی, محمد رضاغفاری, مريم فارسی

تاريخ خاتمه: 1387

خلاصه گزارش: به منظور جداسازي و تعيين مشخصات نشانگرهاي ريز ماهواره از انار(Punica granatum L) ، وجود توالي هاي تكرار دو و سه نوكلوتيدي(GT)،(AC)، (AT)، (CT)، (ATT) و (CTT) در ژنوم رقم تجاري ملس يزد مورد برررسي قرار گرفت. 200 همسانه کانديدای دارای توالی های تكراردار تعيين توال گرديد. توالي دوطرف نواحی تکرار شونده به منظور طراحی آغازگرها شناسايي و تعيين مشخصات گرديدند. 53 جفت آغازگر نشانگر ريزماهواره براساس توالي هاي دوطرف نواحي تکراردار طراحي شد و کارايي آنها در طرح "تهيه بانك اطلاعات مولكولي و مورفولوژيكي انار در ايران" در حال بررسي مي باشد.

عنوان طرح/پروژه: تنوع ژنتيك رزهاي وحشي ايران با استفاده از نشانگرهاي مولكولي

شماره مصوب: 85003-8504-01-14000-013-2

مجري مسئول:

مجري/ مجريان: سيد مصطفي پيرسيدي

همكاران: محسن مردي

تاريخ خاتمه: 1388

خلاصه گزارش: تاكنون DNA 408 ژنوتيپ رز نمونه برداري شده از سرتاسر كشور استخراج شدند. تعداد 21 جفت نشانگر SSR رز بر روي تعدادي از نمونه ها ارزيابی شد. نتايج نشان داد كه نشانگرهای SSR مورد مطالعه دارای چندشکلی مناسب در بين نمونه های رزهاي وحشي ايران نبودند بنابراين اقدامات لازم به منظور جداسازی حداقل 10 نشانگر ريز ماهواره در دستور کار قرار گرفت. در اين راستا 22 همسانه کانديدای دارای نواحی تکرارشونده به منظور توالي يابي ارسال شده است.

عنوان طرح/پروژه: مکان يابي و بيان افتراقي ژن هاي پاسخگو به تنش شوري در گندم

شماره مصوب: 85037-8306-02-140000-013-2

مجري مسئول:

مجري/ مجريان: سيد مصطفي پيرسيدي

همكاران: محسن مردي, مريم فارسی

تاريخ خاتمه: 1389

خلاصه گزارش: در مجموع از 320 لاين مورد مطالعه استخراج DNA با موفقيت انجام شد. تعداد 110 نشانگر ريزماهواره بر روي والدين به منظور شناساسيی چندشکلی مورد مطالعه قرارگرفت که از اين تعداد .38 نشانگر دارای چند شکلي مناسبي بودند. تجزيه های مولکولی با استفاده از نشانگرهای چند شکل روي جمعيت در حال انجام است. در سال جاری تکثير بذور لاين های مورد مطالعه انجام شد و مقدمات ارزيابی های فنوتيپی در سال آينده انجام شد.

عنوان طرح/پروژه: ايجاد نشانگرهاي مولكولي مبتني بر EST پيوسته با مقاومت به بلايت فوزاريومي سنبله در گندم

شماره مصوب: 85005-8306-02-140000-013-2

مجري مسئول:

مجري/ مجريان: محمد رضا غفاری

همكاران: محسن مردي, لاله کريمی فرساد

تاريخ خاتمه: 1387

خلاصه گزارش: ازبين 26 جفت آغازگر طراحی شده بر اساس EST های انتخابی, XSTS3B-138 دارای چندشکلی در بين والدين بود. تجزيه لينکاژی نشان داد XSTS3B-138 برروي كروموزم 3B قرار دارد و داري اثر معني دار در افزايش مقاومت به FHB بود. باند چند شکل تعيين توالي شد. بررسيهاي انجام شده با استفاده از الگوريتم tBLASTx نشان داد كه اين قطعه داراي همولوژي بالايي به Putative resistance protein مي باشد. همچنين قطعه ديگري از اين مکان ژنی كه داراي چند شكلي در بين والدين بود نيز داراي همولوژي بالايي به Nuclear localization singnal ها بود. براي بررسي بيان كمي اين ژن در افزايش مقاومت به بيماري مجدد پرايمرهايي از توالي رديف يابي شده به منظور کاربرد در آناليزهاي Real-time با استفاده از نرم افزار Beacon designer طراحي شد. آناليزهاي Real-time PCR براي اين ژن در زمانهاي 0, 12, 48 و 96 در بافتهاي گلوم، lemma ، Palea و كل سنبله انجام شد. نتايج اوليه نشان داد بيان اين ژن در بافتهاي گلوم، lemma ، Palea گياهان گندم حساس به فوزاريوم افزايش قابل ملاحظه اي تا 5 برابر (5 fold ) تا 24 ساعت بعد از آلودگي دارد. همچنين بررسي بيان كمي آن در سنبله نشان داد كه اين ژن در زمانهاي 24 و 48 ساعت بعد از آلودگي افزايش معني داري نشان نمي دهد اما در زمان 96 ساعت داراي 5/2 برابر افزايش معني دار در نقطه پيك نسبت به گياه حساس فلات بود.